NCBI2R v1.4.7 – インストール日記

バイオインフォ道場、くまぞうです。

今回は、NCBI2Rパッケージのインストールに挑戦です。
NCBI2Rパッケージは、NCBIから得られる情報を使ってSNPsや遺伝子にアノテーション情報を与えるパッケージです。

CRANから提供されなくなっているので、アーカイブから最新版パッケージを取得してインストールします

インストール

DL wget https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/NCBI2R/NCBI2R_1.4.7.tar.gz
R起動 & インストール R > install.pakages(“NCBI2R_1.4.7.tar.gz”)

インストール確認

Rを起動した状態で、NCBI2Rを呼び出してエラーが表示されなければ、インストール完了です。

R > library(NCBI2R)


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