blast 使い方 インストール blast+ v2.3.0

バイオインフォ道場、くまぞうです。

今回はblast+のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。

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インストール

マニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。

  • 場所
    # cd /usr/local
  • ダウンロード
    # wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.3.0/ncbi-blast-2.3.0+-x64-linux.tar.gz
  • 展開
    # tar xzvf ncbi-blast-2.3.0+-x64-linux.tar.gz
  • リンク
    # cd ncbi-blast-2.3.0+/bin
    # ln -s /usr/local/ncbi-blast-2.3.0+/bin/* /usr/local/bin

インストール確認

blast+のコマンド(例:blastn) を呼び出して、バージョンが表示されればインストール完了です。

$ blastn -version

参考情報

BLAST Help [internet]. (NCBI)

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