応用 – バイオインフォ道場 [bioinfo-Dojo]

ruby コマンドライン引数 optparseの利用スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。スクリプトでは、コマンドライン引数（外部から渡す引数）を良く使います。ARGV配列にインデックスを指定することで簡単に取り出せますが、数が多くなると意味がわかりにくくなったり、順番を間 […]

バイオインフォ道場、くまぞうです。正規表現とは正規表現は、文字列をパターンで表現する方法です。テキストエディタの検索に用いられたり、プログラムでテキストを用いた条件判断に使われたりします。ほとんどのプログラム言語で正 […]

バイオインフォ道場、くまぞうです。次世代シーケンサで用いるFASTAファイルやFASTQファイルは大きなサイズのファイルです。「head」を使えば簡単に見ることもできますが、ちょうどキリが良い分量を表示できるかはわかり […]