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バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]

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カテゴリー: 応用

ruby コマンドライン引数 optparseの利用 スクリプトの書き方

2017年7月18日2018年5月24日 bioinfo-dojo 1件のコメント

rubyでは、コマンドライン引数(外部から渡す引数)をARGV配列にインデックス指定することで簡単に取り出せます。しかし、数が多くなると意味がわかりにくくなったり、順番を間違えたりして不便に感じることがあります。そんなと […]

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Ruby 正規表現 スクリプトの書き方

2016年10月19日2017年9月30日 bioinfo-dojo

バイオインフォ道場、くまぞうです。 正規表現とは 正規表現は、文字列をパターンで表現する方法です。テキストエディタの検索に用いられたり、プログラムでテキストを用いた条件判断に使われたりします。ほとんどのプログラム言語で正 […]

続きを読む

Ruby ファイル処理 FASTA,FASTQ抽出 スクリプトの書き方

2016年3月29日2018年5月24日 bioinfo-dojo

バイオインフォ道場、くまぞうです。 次世代シーケンサで用いるFASTAファイルやFASTQファイルは大きなサイズのファイルです。「head」を使えば簡単に見ることもできますが、ちょうどキリが良い分量を表示できるかはわかり […]

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「英話で話す? 必要になるのはもう少し先のこと…」と、つい先延ばしにしていませんか? 今度こそ、英会話の不安をレアジョブで解消しましょう!【一番簡単なはじめかた】はこちら >

例:shell script 文字列, R 複数グラフ など

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