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python pandas「データの参照方法〜whereの使い方」

バイオインフォマティクスでは、数百〜数万の遺伝子やサンプルに関するデータを効率よく操作・解析することが求められます。Pythonのpandasライブラリは、そのような大量データを扱う上で非常に強力なツールです。今回は、pandasを使った「...
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Python pandas「データ参照とbool型参照」の基本と応用

バイオインフォマティクスでは、大量のゲノムデータや遺伝子発現データを扱うことが一般的です。こうした複雑かつ大規模なデータを効率よく処理するためには、Pythonのpandasライブラリが非常に有効です。特に、データの参照方法(行・列の取り出...
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pandas:属性参照の基本と応用

Pythonのpandasライブラリは、バイオインフォマティクスにおけるデータ解析に欠かせないツールです。遺伝子発現データ、メタデータ、シーケンス情報など、多次元かつ大量のデータを柔軟に扱うための機能が豊富に揃っています。この記事では、pa...
linuxに関すること

Linuxの基本コマンド:ファイルやディレクトリの削除「rm」の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に管理・解析するためにLinuxの基本コマンドを活用することが重要です。その中でも、「ファイルやディレクトリの削除」を行う rm コマンドは頻繁に使われるものの一つです。本記事では、GNU ...
R言語

R tidyverse 活用: 累積積 を計算するcumprod() の使い方

はじめにバイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うことが一般的です。遺伝子発現データやゲノム解析データを効率的に処理するために、R の tidyverse パッケージは非常に便利なツールとなります。特に dplyr はデータの加工や集...
pandas

Python pandasライブラリ:スライスを使ったデータ参照について

バイオインフォマティクスにおいて、遺伝子発現データやDNA配列データを効率的に処理するためには、Pythonの pandas ライブラリが非常に有用です。特に データの参照とスライス(切り出し) は、大量のバイオデータを適切に処理するために...
R言語

R tidyverse:データの累積和cumsum()の使い方

バイオインフォマティクスのデータ解析では、大量の数値データを扱うことが一般的です。特に、遺伝子発現データやDNA配列解析の結果を効率的に処理するために、tidyverseパッケージ群の一部であるdplyrが非常に役立ちます。今回は、データの...
pandas

Python pandasライブラリ:データの可視化について

バイオインフォマティクスでは、遺伝子発現データ、SNPデータ、RNA-Seqデータ、タンパク質相互作用データなど、大量のデータを解析する場面が多くあります。その際、データの傾向や異常値を素早く把握するために 「データの可視化」 が非常に重要...
linuxに関すること

Linux基本コマンド:ファイルやディレクトリの移動「mv」の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うため、Linuxのコマンドを駆使することが効率的なデータ管理につながります。特に、ファイルの整理や移動に便利なコマンドとして mv(move)があります。本記事では、mv の基本から応用までを...
R言語

R tidyverse の活用: 累積最大値を計算する「cummax()」の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱う機会が多く、効率的なデータ操作が求められます。R の tidyverse は、そのようなデータ処理を直感的かつ簡潔に記述できる強力なツールキットです。特に dplyr パッケージは、データのフ...
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