linuxに関すること Linux基本コマンド:データをランダムに並べ替える「shuf」 の使い方 バイオインフォマティクスの現場では、膨大なデータを処理するためにLinuxの基本コマンドを活用することが不可欠です。その中でも、shuf コマンドは、データのランダム化に便利なツールです。本記事では、shuf のバイオインフォマティクスでの... linuxに関すること
R言語 R tidyverse:特定の列を選択 「select」 の使い方 バイオインフォマティクスのデータ解析では、大量のデータを扱うため、効率的なデータ操作が不可欠です。その中で R の tidyverse は、データの整形・可視化・解析をスムーズに行うための強力なツールです。特に、dplyr パッケージの s... R言語tidyverse
Python Python3:クラス機能の拡張「クラスデコレーター」とは? バイオインフォマティクスでは、Python3 のオブジェクト指向プログラミング(OOP)が非常に重要です。特に、大規模なデータ解析や機械学習を行う際、コードの再利用性や保守性を高めるために、クラスやデコレーターの概念を理解することが役立ちま... Python
linuxに関すること Linux基本コマンド:行単位でテキスト並べ替え「sort」の使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に処理する必要があります。その際、Linuxの基本コマンドを活用することで、データの前処理や解析を効率化できます。本記事では、Linux の sort コマンドに焦点を当て、基本的な使い方か... linuxに関すること
R言語 R tidyverse:特定の列からベクトル取得「 pull() 」の使い方 バイオインフォマティクスでは、膨大なデータを扱うために、効率的なデータ操作が欠かせません。その中でも tidyverse の dplyr は、データフレームを扱う際に非常に強力なツールです。今回は、その中でもシンプルながら便利な pull(... R言語tidyverse
Python Pythonのオブジェクト指向を深く理解する〜メタクラスとは? バイオインフォマティクスの分野では、Python3 を用いたデータ解析や機械学習の活用が重要です。その中で、オブジェクト指向プログラミング(OOP)の理解はコードの効率化や再利用性の向上に役立ちます。特に、Python の「メタクラス」は、... Python
linuxに関すること Linuxコマンド:データチェック「md5sum」の使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うため、データの正確性や整合性を確認することが重要です。そのため、Linuxの基本コマンドを駆使して、データのチェックや管理を行うことは必須スキルの一つとなります。この記事では、GNU core... linuxに関すること
R言語 R tidyverse :新しい行を追加「add_row」の使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に処理・分析することが求められます。その際、tidyverse の活用はデータ解析のスピードと再現性を向上させる重要な要素となります。本記事では、dplyr パッケージの add_row()... R言語tidyverse
Python Python3:コンテナ型の特殊メソッドの使い方 バイオインフォマティクスでは、Pythonを使ってDNA配列やタンパク質データを解析する機会が多くあります。特に、リストや辞書などのコンテナ型(Container)のデータ構造を活用することが多く、効率的なデータ操作が求められます。Pyth... Python
R言語 R tidyverse:指定した列の値の並べ替え 「arrange」 の使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に処理し、解析することが求められます。そのために、R の tidyverse パッケージ群が強力なツールとなります。特に、dplyr パッケージを活用すると、データのフィルタリング、集計、変... R言語tidyverse