ratio 1.5倍は、logFCで何？

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R言語

2020.06.282021.12.22

bioinfomatics では、ratio や logFC を変動の閾値としてよく使います。

ratio 2倍・4倍なら、対数表現も１・２と簡単にわかりますが、1.5倍などを閾値とした場合は、対数で何になるか覚えておくのは大変です。これらは、Rのコマンドや電卓で簡単に確認できるので、確認方法を覚えておけば安心です。

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目次

ratio 1.5倍が logFC で何かを確認する方法
1. Rの関数で確認する場合
2. 電卓で確認する場合
底の変換公式を覚えておくと便利
論文・データ解析の支援
関連記事１
関連記事２

ratio 1.5倍が logFC で何かを確認する方法

Rの関数で確認する場合

log2は、底が２の対数を求める関数です。Rを起動して、log2関数に求めたい数を入力します。

# Rを起動
log2(2)
[1] 1

log2(1.5)
[1] 0.5849625

電卓で確認する場合

ubuntu の電卓（プログラミングモード）で確認しました。
「log2」ボタンを使います。

底の変換公式を覚えておくと便利

ちなみに、底が自然対数しか使えない場合、log2(1.5)を求めるときは、底の変換公式を使って計算します。

$ bc -l # bc 標準数学ライブラリを使用

l(1.5)/l(2)
.58496250072115618144

論文・データ解析の支援

個別に直接相談できるのが良いと、たくさんの方にご利用頂いています。

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