R言語 R 使い方 | volcano plot 描き方(ボルケーノプロット) volcano plotは、発現解析の結果を表現でよく使われるグラフです。 横軸に発現比(logFC)、縦軸にpvalue(-log10した値)をとります。 Rを使って、volcano plot (ボルケーノ プロット)を作成... R言語グラフメインコンテンツ
R言語 R 4.0 インストール ubuntu Rのインストール手順について。 最近よくつかう「tidyverse」も一緒にインストールします。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 R 4.0 インストール手順 事前設定 $ su... R言語tidyverseメインコンテンツ
R言語 Rの使い方 ベン図 左右入れ替え ベン図を入れ替える場合、左右の回転を指定します。 180度で左右反転します。 venn.diagram(x=list("A"=1:9, "B"=5:16), filename="venn_diag... R言語グラフメインコンテンツ
R言語 AnnotationHub インストール bioinformatics では「R」をよくつかいますが、パッケージのインストールなのでトラブルことがあります。 アノテーション作業で使う機会があるかもしれない、AnnotationHub インストールについて。 R... R言語メインコンテンツ
R言語 ratio 1.5倍は、logFCで何? bioinfomatics では、ratio や logFC を変動の閾値としてよく使います。 ratio 2倍・4倍なら、対数表現も1・2と簡単にわかりますが、1.5倍などを閾値とした場合は、対数で何になるか覚えておくのは大変です... R言語メインコンテンツ
R言語 r tidyverse 使い方 | 列分割 separate関数 – tidyrパッケージ tidyverseで1つの列(文字列型)を分割して別の列に分けるには、tidyrパッケージのseparate関数を使います。separate関数は、「指定した列」を「指定した区切り文字」で分割します。Rの標準的な操作strsplit関数を... R言語tidyverseメインコンテンツ
R言語 r tidyverse 使い方 | 行 グループ毎の処理 group_by関数 – dplyrパッケージ tidyverseでデータフレームをグループ別に処理する場合、dplyrパッケージのgroup_by関数を使います。group_by関数以降の処理では、グループ毎に計算が行われます。Rの標準的な操作なら、apply系関数を使って同じような... R言語tidyverseメインコンテンツ
R言語 r tidyverse 使い方 | データフレーム重複行を削除 distinct関数 – dplyrパッケージ tidyverseでデータフレームの重複行の削除を行う場合、dplyrパッケージのdistinct関数を使います。重複をチェックする列名を指定し、重複が見つかった行は最初に見つかったデータを残して、それ以外は削除されます。Rの標準的な操作... R言語tidyverseメインコンテンツ
R言語 r tidyverse 使い方 | 列の追加 mutate関数 – dplyrパッケージ tidyverseでデータフレームに列を追加する場合は、dplyrパッケージのmutate関数を使います。新しい列を追加したり、既にある列に上書きすることができます。また、transmutateという関数を使った場合は、列を追加しつつ、s... R言語tidyverseメインコンテンツ
R言語 r tidyverse 使い方 | 行のソート arrange関数 – dplyrパッケージ tidyverseで1つのデータフレームに対する行のソートは、dplyrパッケージのarrange関数を使います。arrange関数は、データフレームの行をソートする関数です。エクセルの行の並べ替えのように、優先度の高いものから複数の条件... R言語tidyverseメインコンテンツ