Python Python3〜データクラスとハッシュ可能なクラス バイオインフォマティクスの解析では、大量のデータを効率的に処理することが求められます。そのため、Pythonのオブジェクト指向プログラミング(OOP)を活用することで、データの管理をより直感的かつ再利用可能にすることができます。本記事では、... Python
linuxに関すること Linux基本コマンド:ファイルの末尾部分を表示「tail」 の使い方 バイオインフォマティクスでは、膨大なデータを扱うことが多く、効率的にデータを処理するスキルが求められます。そのためには、Linux の基本コマンドを活用することが不可欠です。本記事では、GNU coreutils の一部である tail コ... linuxに関すること
R言語 Rのtidyverse:行を指定して抽出slice()の使い方 バイオインフォマティクスでは、大規模なデータセットを効率的に処理することが求められます。Rのtidyverseパッケージ群は、データの整形や可視化に強力なツールを提供し、その中でもdplyrはデータ操作の中心的な役割を果たします。本記事では... R言語tidyverse
Python Python3 〜 オブジェクト指向のイミュータブル(不変)なクラス はじめにバイオインフォマティクスでは、DNA配列やタンパク質構造のデータを扱うことが多く、データの整合性を保ちながら処理を進めることが求められます。そのため、Pythonのオブジェクト指向プログラミング(OOP)の考え方を理解し、適切に活用... Python
linuxに関すること Linuxの基本コマンド ファイルの先頭を表示「head」 コマンドの使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うことが日常的です。特に、NGS(次世代シーケンス)の解析や遺伝子発現データの処理では、大規模なテキストファイル(FASTA、FASTQ、CSV、TSVなど)を効率的に確認・操作することが求めら... linuxに関すること
R言語 Rのtidyverse:行の重複削除「distinct」の使い方 バイオインフォマティクスの分野では、大量のデータを処理・解析するためにRのtidyverseパッケージ群が頻繁に活用されます。特に、データの整理やフィルタリングに便利なdplyrパッケージは、遺伝子発現データやゲノムデータの解析において強力... R言語tidyverse
Python Python3~データクラスのfield関数を使ったカスタマイズについて バイオインフォマティクスの分野では、大量のデータを扱うことが日常的です。Python3はその柔軟性と豊富なライブラリ群のおかげで、データ処理の強力なツールとなっています。その中でも、オブジェクト指向プログラミング(OOP) の考え方を活かす... Python
linuxに関すること Linux基本コマンド:テキスト整形「fold」 の使い方 バイオインフォマティクスでは、大量のテキストデータ(DNA配列、タンパク質データ、ゲノムアノテーションなど)を扱うことが多く、Linuxの基本コマンドを使いこなすことが非常に重要です。今回は、GNU coreutils に含まれる fold... linuxに関すること
R言語 Rのtidyverse~行の条件抽出「filter」の使い方 dplyr の filter() の基本と応用バイオインフォマティクスでは、大規模なデータセットを効率よく処理するために R の tidyverse が非常に有用です。特に、dplyr はデータの操作を直感的に記述できる強力なパッケージであ... R言語tidyverse
Python Python3 ~ データクラスとは? バイオインフォマティクスの分野では、膨大なデータを効率的に処理することが求められます。そのため、Python3のオブジェクト指向プログラミング(OOP)を活用することで、データの管理をより簡潔かつ効率的に行うことができます。本記事では、OO... Python