![バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]](https://bioinfo-dojo.net/wp-content/uploads/2016/03/some_object_luca-bravo-alS7ewQ41M8-unsplash.jpg)
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリリスト表示「vdir」の使い方
バイオインフォマティクスでは、膨大なデータを処理するためにLinux環境を活用することが一般的です。Linuxの基本的な操作を理解し、適切にコマンドを使いこなすことは、データ解析の効率を大幅に向上させます。本記事では、vdir コマンド に...
linuxに関すること R言語 R tidyverse：正規表現で列をフィルタリング「matches」の使い方
バイオインフォマティクスにおいて、データ解析の効率を向上させるために Rのtidyverse を活用しようと考えている方も多いのではないでしょうか？その中でも、dplyr はデータ操作において強力なツールです。特に、列名のパターンマッチング...
pandas Python pandasの活用：データの参照方法【基本】
バイオインフォマティクスでは、大規模なデータセットを効率的に処理するために Pythonのpandasライブラリ を活用することが重要です。遺伝子発現データ、変異データ、タンパク質の相互作用データなどを扱う際に、データの「参照（アクセス）」...
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリの内容をシンプルに表示「dir」 の使い方
バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うため、Linux の基本コマンドを駆使することが求められます。その中でも、ファイルやディレクトリを素早く確認するための dir コマンド は、作業の効率化に役立ちます。本記事では、dir コマ...
R言語 R tidyverse：列の選択「指定したすべての列 all_of」 と 「存在する列だけany_of()」 の使い方
バイオインフォマティクスの解析には、tidyverse の dplyr パッケージが非常に便利です。特に、遺伝子発現データやサンプル情報のデータフレームを操作する際には、列の選択 (select() や mutate()) やフィルタリング...
pandas Python pandasを活用：データの表示方法について
バイオインフォマティクスでは、遺伝子発現データや配列データなど、大量のデータを扱うことが日常的です。Pythonの pandas ライブラリを活用すれば、これらのデータを効率的に処理・解析できます。本記事では、pandasの 「データの表示...
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリ内のファイル・ディレクトリ一覧を表示「ls」の使い方
Linuxは、バイオインフォマティクスの解析環境として非常に広く利用されています。多くの解析ツールやパイプラインがLinux上で動作するため、日常的にLinuxの基本コマンドを駆使することは、データ管理や解析作業の効率化に直結します。今回は...
R言語 R tidyverse：列名と指定した文字列「starts_with/ends_with」の使い方
バイオインフォマティクスのデータ解析では、大量のデータを効率的に操作することが求められます。Rのtidyverseパッケージは、そのようなデータ操作を簡潔かつ直感的に行うための強力なツールセットを提供しています。中でも、dplyrパッケージ...
pandas Python pandasライブラリ：データの読み込みについて
バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱う機会が多く、効率的にデータを処理するためのツールが必要不可欠です。その中でも、Pythonのpandasライブラリは、データの読み込み、整理、解析において非常に強力な機能を提供します。本記事で...
linuxに関すること Linuxの基本コマンド：タブをスペースに変換する「expand」 の使い方
バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に処理するためにLinuxの基本コマンドを活用することが重要です。特に、テキストデータの整形は、解析の前処理として欠かせません。今回は、expand コマンドを紹介します。このコマンドは、タ...