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pandas

Pythonのpandas活用:データフレームの操作

バイオインフォマティクスでは、DNAやRNAのシーケンスデータ、遺伝子発現データ、タンパク質の相互作用データなど、多種多様なデータを扱います。これらのデータはしばしば大規模かつ構造化されており、効率的に処理するためにPythonの pand...
linuxに関すること

Linuxの基本コマンド:テキストデータの「列」を切り出す「cut」の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを処理する必要があり、そのためにはLinuxの基本コマンドを活用することが不可欠です。特に、テキストデータを処理する際にはLinuxのコマンド群が役立ちます。本記事では、「Operating on ...
R言語

R dplyr:行ごと・複数の列の処理「c_across」 の使い方

バイオインフォマティクスのデータ解析では、複雑なデータセットを効率的に操作するスキルが求められます。その中でも dplyr は、データ操作を簡潔に記述できる R の強力なパッケージです。特に、rowwise() と組み合わせて使う c_ac...
pandas

Python pandas:表形式のデータ構造「データフレーム」の使い方

バイオインフォマティクスのデータ解析では、膨大な実験データを効率的に処理することが求められます。Pythonのpandasライブラリは、こうしたデータ解析に非常に便利なツールの一つです。その中でも、**データフレーム(DataFrame)*...
linuxに関すること

Linux基本コマンド:ファイルを比較「comm」の使い方

バイオインフォマティクスでは、Linuxのコマンドを使って大量のデータを効率よく処理することが求められます。特に、ゲノム配列データや遺伝子リストなどのテキストデータを扱う際には、テキスト処理コマンドを駆使することが不可欠です。本記事では、G...
R言語

R tidyverse:複数の列に対して一括で操作「across()」 の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを効率的に処理し、解析することが求められます。R の tidyverse パッケージは、そのようなデータ処理に非常に有用なツールを提供しています。本記事では、dplyr::across() に焦点を...
pandas

Pythonのpandas活用:シリーズ(Series)の操作

バイオインフォマティクスにおいて、データ解析は不可欠な作業です。Pythonのpandasライブラリは、データの整形、解析、可視化などにおいて強力なツールとして広く利用されています。特に、Series(シリーズ)はpandasのデータ構造の...
linuxに関すること

Linux の基本コマンド:重複した行に関する操作「uniq」 の使い方

バイオインフォマティクスのデータ解析では、大量のテキストデータを効率的に処理する必要があります。その際、Linux の基本コマンドは強力なツールとなります。本記事では、GNU coreutils に含まれる uniq コマンド に焦点を当て...
R言語

R tidyverse:列の順序を変更 「relocate」 の使い方

バイオインフォマティクスでは、大量のデータを整理し、解析しやすい形に整えることが不可欠です。特に R の tidyverse は、データの前処理や可視化をスムーズに行うための強力なツールです。その中でも dplyr は、データフレームの操作...
pandas

Pythonのpandas:ラベル付きの一列のデータ「シリーズ(Series)」の使い方

バイオインフォマティクスでは、膨大なデータを扱うことが一般的です。遺伝子発現データ、DNAシーケンス、タンパク質のインタラクションデータなど、多様な情報を処理する必要があります。そのため、データ解析を効率的に行うためには、Pythonの p...
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