![バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]](https://bioinfo-dojo.net/wp-content/uploads/2016/03/some_object_luca-bravo-alS7ewQ41M8-unsplash.jpg)
linuxに関すること Linux基本コマンド：ファイルやディレクトリのコピー「cp」の使い方
バイオインフォマティクスでは、大量のデータファイルを効率的に管理することが不可欠です。Linuxの基本コマンドの一つである cp は、ファイルやディレクトリのコピーを行うための重要なツールです。この記事では、cp コマンドの基本的な使い方解...
linuxに関すること R言語 R tidyverse：指定した数だけ前にずらす「lag」の使い方
バイオインフォマティクスのデータ解析では、時系列データや連続データを扱うことがよくあります。こうしたデータの前後関係を分析する際に便利な関数のひとつが、lag() です。lag() は、データの各要素を一つ前の値と比較したいときに役立つ関数...
pandas Python pandasライブラリの活用：データのソートについて
バイオインフォマティクスでは、大量のデータを整理し、解析することが重要です。Pythonの pandas ライブラリを使うと、遺伝子発現データ、変異データ、臨床データなどを簡単に扱えます。その中でも、「データの並べ替え」 は基本的な操作の一...
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリリスト表示「vdir」の使い方
バイオインフォマティクスでは、膨大なデータを処理するためにLinux環境を活用することが一般的です。Linuxの基本的な操作を理解し、適切にコマンドを使いこなすことは、データ解析の効率を大幅に向上させます。本記事では、vdir コマンド に...
R言語 R tidyverse：正規表現で列をフィルタリング「matches」の使い方
バイオインフォマティクスにおいて、データ解析の効率を向上させるために Rのtidyverse を活用しようと考えている方も多いのではないでしょうか？その中でも、dplyr はデータ操作において強力なツールです。特に、列名のパターンマッチング...
pandas Python pandasの活用：データの参照方法【基本】
バイオインフォマティクスでは、大規模なデータセットを効率的に処理するために Pythonのpandasライブラリ を活用することが重要です。遺伝子発現データ、変異データ、タンパク質の相互作用データなどを扱う際に、データの「参照（アクセス）」...
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリの内容をシンプルに表示「dir」 の使い方
バイオインフォマティクスでは、大量のデータを扱うため、Linux の基本コマンドを駆使することが求められます。その中でも、ファイルやディレクトリを素早く確認するための dir コマンド は、作業の効率化に役立ちます。本記事では、dir コマ...
R言語 R tidyverse：列の選択「指定したすべての列 all_of」 と 「存在する列だけany_of()」 の使い方
バイオインフォマティクスの解析には、tidyverse の dplyr パッケージが非常に便利です。特に、遺伝子発現データやサンプル情報のデータフレームを操作する際には、列の選択 (select() や mutate()) やフィルタリング...
pandas Python pandasを活用：データの表示方法について
バイオインフォマティクスでは、遺伝子発現データや配列データなど、大量のデータを扱うことが日常的です。Pythonの pandas ライブラリを活用すれば、これらのデータを効率的に処理・解析できます。本記事では、pandasの 「データの表示...
linuxに関すること Linux基本コマンド：ディレクトリ内のファイル・ディレクトリ一覧を表示「ls」の使い方
Linuxは、バイオインフォマティクスの解析環境として非常に広く利用されています。多くの解析ツールやパイプラインがLinux上で動作するため、日常的にLinuxの基本コマンドを駆使することは、データ管理や解析作業の効率化に直結します。今回は...