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C言語シェルソートスクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。アルゴリズムには、無駄がなく効率的に処理をおこなうための様々な工夫があります。バイオインフォマティクスでは大きなデータを扱うことが多いので、様々なアルゴリズムの考え方を身につけておくと何かの役に立つかもしれ...

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チャートやグラフは、データの理解を手助けしてくれます。「統計ソフト R」では様々なグラフが手軽に描けるので便利です。単体のチャートやグラフでも役に立ちますが、表現には限界があり、一長一短となるものも少なくありません。異なる種類のチャートやグ...

R言語グラフメインコンテンツ

バイオインフォ道場、くまぞうです。無駄がなく効率的なアルゴリズムには様々な工夫があります。バイオインフォマティクスでは大きなデータを扱うことが多いので、様々なアルゴリズムの考え方を身につけておくと何かの役に立つかもしれません。尚、ソートプロ...

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統計処理などで２変数の関係を調べるときに、良く使われるのが散布図です。少し工夫するとより使いやすくなります。散布図の工夫についてまとめます。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談散布図を描く散布図はplot関数を使って...

R言語グラフメインコンテンツ

バイオインフォマティクスでは、条件の差による結果の差を比較したりします。それぞれの条件から得た結果を変数として比較するときに、まず確認したいのが相関です。そのとき、良く使われるのが散布図や相関係数です。２つの変数の関係を調べるスポンサーリン...

ExcelR言語メインコンテンツ統計

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは、統計処理をよく活用します。大きく変化しているなどの判断基準にも使われる値として、Z-scoreがあります。統計ソフトRを使って求めてみます。スポンサーリンク(adsbygoog...

R言語メインコンテンツ統計

バイオインフォマティクスの解析では、様々なツールを使います。たまにはエラーに遭遇してしまい、解決するのに時間がかかったりします。BLASTは、大変使用頻度の高いツールの１つですが、見慣れないエラーに遭遇したので、エラーと対応方法をまとめます...

blastメインコンテンツ解析ツール

バイオインフォマティクスでは、大きなファイルを扱う機会が多いです。小さなファイルに分割すれば、サーバーで分散処理して大幅な時間短縮を行うことが出来るかもしれません。いくつかのツールを組合せてFASTAファイルを小さく分割してみます。とにかく...

FASTX-Toolkitシェルスクリプトメインコンテンツ

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは大きなファイルを扱うことが多いです。処理を高速化するために、Ｃ言語を使ってプログラムを組むと必要になるのが文字列処理です。スクリプト言語に比べて、扱い易さは少し劣るかもしれません...

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バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスの解析作業では、大きなファイルを扱うことが多いです。スクリプト言語はとても扱いやすいですが、一般的に実行速度を犠牲にします。こんなときはＣ言語などのプログラム言語を使うと高速な処理を...

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