linuxに関すること

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Midnight Commander (mc) 使い方 基本コマンド10選+

Midnight CommanderはCUIベースのファイルマネージャーです。マウス操作なしで、ファイル操作を快適に行うことができます。表示が2カラムに分かれていて、コピーなどフォルダをまたぐ操作の場合に、コピー先のフォルダの内容も同時に...
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解析トラブル Linuxマシンの動作のもたつき 原因調査と解決策

バイオインフォマティクス解析で使用するツールは、計算が長く続いたり、メモリを大量に必要とするもの、たくさんのファイルを出力するものなど、大きな負荷がかかるものが多いです。このようなツールを使う場合、コンピュータのパフォーマンス管理がしっか...
AWS

はじめてのcrontab実行 AWS S3へ自動バックアップ

バイオインフォマティクスでは、重要なデータを使うことが多いのでバックアップ作業などは定期的に実行したいものです。確実に、そして簡単に、データバックアップのような単純な処理を、定期的に実行してくれるcrontabを試してみましょう! ...
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不要なファイルを探す ファイル名・ファイルサイズ・ファイル更新日時

バイオインフォマティクスの解析では大きなファイルを扱うことが多いので、ストレージの管理には気を使います。ストレージの容量を確保するために、不要なファイルはこまめに削除(または他の場所へ移動・圧縮など)することが、もっとも簡単で確実な方法だ...
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Zstandard 可逆圧縮アルゴリズムを使ってみる

バイオインフォマティクスの解析では、とても大きなファイルを取り扱うことがあります。解析後もデータを安全に長期間保存しておく必要があって、データ保存に対する悩みは尽きません。 より速く、より高い圧縮率でファイルを小さく圧縮できれば、そ...
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Docker install ubuntu 20.04

無償版 docker ceをインストールして、hello worldの動作確認まで行います。 Docker とは? 「コンテナ」型の仮想化技術で、アプリケーションやサーバーを動かす技術です。 Dockerでは、サーバーの...
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作業効率 コンソールでGoogle検索を利用する

バイオインフォマティクスの作業でLinuxを使う場合、コマンドラインツールを使ったり・スクリプトを作ったりして、コンソールでの操作が多くなると思います。ネットの検索はブラウザーでGUIを使うのも良いですが、いちいちアプリケーションを切り替...
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英語 コンソール画面で翻訳

英語は、論文を読んだり・バイオインフォマティクスで使うツールのドキュメントを読むときには、必須のスキルです。しかし、専門的な表現が出てくることも多いので、翻訳が必要になることもあります。 いちいちネットや辞書で調べていると作業効率が...
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データの使用量を確認する ディスク使用量アナライザーで視覚的に確認できる

バイオインフォマティクスでは大きなデータを使用するので、ひと目で大きなデータがわかると重宝します。そのようなファイルは、シェルで検索することもできますが、ディスク使用量アナライザーを使えばGUIで視覚的に確認することができます。 デ...
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破壊するか上書きするか、安全なデータ破棄について

「データは削除したから大丈夫!」と思っていても、廃棄したPCやハードディスクから「消したはずの重要なデータ」が読み取られることがあります。 データ削除とデータ復旧ソフト 「データが外部に漏れてしまった!」ということがないように...
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