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R言語

R 使い方 軸・ラベルの調整(向き・サイズ・色など) グラフの描き方

Rによるplot(グラフ)の描画は、手軽で大変便利です。ただ、細かい調整に関しては、全てをデフォルトに任せるわけにはいかないようです。今回は軸について、色々と制御してみます。軸の表示を制御する軸ラベルを変更する・消すx軸・y軸のラベルをそれ...
C言語

C言語 シェルソート スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。アルゴリズムには、無駄がなく効率的に処理をおこなうための様々な工夫があります。バイオインフォマティクスでは大きなデータを扱うことが多いので、様々なアルゴリズムの考え方を身につけておくと何かの役に立つかもしれ...
R言語

R 使い方 チャートやグラフの組合せ グラフの描き方

チャートやグラフは、データの理解を手助けしてくれます。「統計ソフト R」では様々なグラフが手軽に描けるので便利です。単体のチャートやグラフでも役に立ちますが、表現には限界があり、一長一短となるものも少なくありません。異なる種類のチャートやグ...
C言語

C言語 バブルソート,基本選択法 スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。無駄がなく効率的なアルゴリズムには様々な工夫があります。バイオインフォマティクスでは大きなデータを扱うことが多いので、様々なアルゴリズムの考え方を身につけておくと何かの役に立つかもしれません。尚、ソートプロ...
R言語

R 使い方 散布図 工夫(透明度・グラフ並べるなど) グラフの描き方

統計処理などで2変数の関係を調べるときに、良く使われるのが散布図です。少し工夫するとより使いやすくなります。散布図の工夫についてまとめます。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談散布図を描く散布図はplot関数を使って...
Excel

相関と散布図 | 統計の活用

バイオインフォマティクスでは、条件の差による結果の差を比較したりします。それぞれの条件から得た結果を変数として比較するときに、まず確認したいのが相関です。そのとき、良く使われるのが散布図や相関係数です。2つの変数の関係を調べるスポンサーリン...
R言語

z-score 計算方法 R 編

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは、統計処理をよく活用します。大きく変化しているなどの判断基準にも使われる値として、Z-scoreがあります。統計ソフトRを使って求めてみます。スポンサーリンク(adsbygoog...
blast

blast 使い方 エラーと解決 tblastx

バイオインフォマティクスの解析では、様々なツールを使います。たまにはエラーに遭遇してしまい、解決するのに時間がかかったりします。BLASTは、大変使用頻度の高いツールの1つですが、見慣れないエラーに遭遇したので、エラーと対応方法をまとめます...
FASTX-Toolkit

シェルスクリプト FASTAファイルの分割 fastx_toolkit, sed, コマンドの活用例

バイオインフォマティクスでは、大きなファイルを扱う機会が多いです。小さなファイルに分割すれば、サーバーで分散処理して大幅な時間短縮を行うことが出来るかもしれません。いくつかのツールを組合せてFASTAファイルを小さく分割してみます。とにかく...
C言語

C言語 文字列処理 コピー,比較,連結 スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは大きなファイルを扱うことが多いです。処理を高速化するために、C言語を使ってプログラムを組むと必要になるのが文字列処理です。スクリプト言語に比べて、扱い易さは少し劣るかもしれません...
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