linuxに関すること

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ハードディスク容量が足りないかも! -df, duで使用量を確認-

バイオインフォマティクスでは比較的容量の大きいファイルを使用するので、ハードディスクの容量が足りなくなることもあります。慌てることが無いように、dfコマンドやduコマンドを使ってハードディスクの容量をこまめに確認しましょう。 ディスク...
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linux コマンド md5sum ファイルのダウンロードチェック

バイオインフォ道場、くまぞうです。 バイオインフォマティクスでは、大きなデータを扱う機会が良くあります。大きなデータや大量のデータをネット経由でダウンロードする際は、きちんとダウンロードできたか心配になるときがあります。このようなとき...
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バックグラウンド実行とフォアグラウンド実行 -プログラムの色んな実行方法-

解析プログラムは長い時間を必要とするものもあります。プログラムの実行や管理方法を理解して、作業効率を効率的に行いましょう。 バックグラウンド実行とフォアグラウンド実行 バックグラウンド実行をうまく活用しよう プログラムの...
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linux コマンド which・whereis プログラムのパスを表示

初歩から資格取得まで(資料無料送付) バイオインフォ道場、くまぞうです。 whichコマンドはプログラムのパスを表示します。whereisコマンドは、プログラムに関連したその他のファイルのパスも表示します。Li...
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boot領域不足という警告が出たときの対応 – Ubuntu –

バイオインフォ道場、くまぞうです。 解析用PCとして、Linux(今回はUbuntu)を長い間使い続けていたりすると、「boot領域不足」という警告が出ることがあります。自動アップデートができなくなったりして困るので対処しましょう。...
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PPAを登録してJava1.8へ更新

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回は、java Runtimeを1.8にアップグレードしたいと思います。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || [])...
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linux コマンド apt-get ・ dpkg パッケージ管理

バイオインフォ道場、くまぞうです。 パッケージ管理についてまとめます。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); パッ...
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Linuxでパスを通す PATH(パス)の通し方と注意点

バイオインフォマティクスで利用するツールは、自分でコンパイルが必要なものや環境を整える必要なものがあります。必要な設定の1つに「パスを通す」ことがあります。「PATH」を通すとツールの起動が楽になります。是非、設定や確認の仕方を覚えましょう...
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書庫を作成を便利にする – 知っていると便利!特定のファイルを除外する3つの方法

バイオインフォ道場、くまぞうです。 まずは書庫を作る たくさんのファイルや、たくさんのファイルが入ったフォルダは書庫にすると管理が楽な場合があります。特に、ネットワーク経由でファイルをやりとりする場合や、他人にファイルを渡したり...
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sqlite3 v3.11.0 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回は、SQLiteのインストールに挑戦です。SQLiteのサイトからソースコードをダウンロードして、ソースコンパイルでインストールします。 ソースコードが2種類準備されています。config...
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