linuxに関すること

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linux コマンド パイプの使い方

バイオインフォ道場、くまぞうです。 パイプはコマンドの処理を左から右へつなぐので、パイプライン処理と言います。「|」(パイプ:vertical line)の左側で実行したコマンドの結果を、「|」の右側のコマンドの入力として処理します。...
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知ってると便利!コントロールキーのいろんな機能

バイオインフォ道場、くまぞうです。 コンソールでコマンドを使うときに覚えておいたほうが便利なキー操作をまとめます。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || [...
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linux コマンド uniq ファイル内の重複行チェック

バイオインフォ道場、くまぞうです。 ソート済みのファイルから重複しない行を抽出します。ソートしていないファイルでは「uniq」処理できません。「sort」実行後に「uniq」処理するのを習慣化した方が良いと思います。 スポンサー...
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linux コマンド grep ファイル内の文字列検索

バイオインフォ道場、くまぞうです。 テキストファイル内の文字列を検索します。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); ...
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linux コマンド sort ファイルのソート

バイオインフォ道場、くまぞうです。 テキストファイルの行をソートして並べ替えます。 構文 sort
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Screen v4.01 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回は、Screenのインストールに挑戦です。 Screenは仮想端末マネージャです。コンソール内に複数のWindowを作ることができます。コンソールの分割や切り替えなどもできて大変便利なツー...
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linux tar 圧縮ファイルの解凍 コマンド

Linuxでは tar コマンドで圧縮ファイルの作成・展開を行います。標準的に使われる圧縮形式gzip形式(.gz)とbzip2形式(.bz2)の展開を行うことができます。Linux の tar コマンドは、書庫化や圧縮・解凍も出来ますが、...
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linux コマンド apt-get パッケージ管理

バイオインフォ道場、biくまぞうです。 Linuxのパッケージを管理します。インストールや、アンインストール、最新情報への更新などを行うときに使います。Debian系のディストリビューション(Ubuntu・SteamOSなど)で使用可...
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Java JRE(Java Runtime Environment) – インストール

Java Runtimeのインストールについてです。 Javaで書かれた解析ツール(FastQCなど)を使用する場合は、インストールが必要です。尚、FastQC v0.11.4では1.6以上が必要。
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linux コマンド wc ファイルの単語数と行数を数える

バイオインフォ道場、biくまぞうです。 ファイルの単語数や行数を表示します。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); ...
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