linuxに関すること

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bash リダイレクションによる上書き禁止

何かコマンドからの出力を簡単にファイルに残しておけるので、リダイレクトは良く使います。しかし、たまに大事な既存ファイルに上書きしてしまって失敗することがあります。そんな「よくあるリダイレクトミス」を防ぎましょう!リダイレクトで上書き禁止する...
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パスワード自動生成 APG Linuxコマンドの使い方

バイオインフォ道場、くまぞうです。パスワードは「1つのサービスに1つのパスワード」で使い回しを避けるスポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});大きなデータを日常的に扱...
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共有ライブラリのエラー対処法

バイオインフォ道場、くまぞうです。共有ライブラリのエラーが発生した場合の対応方法についてまとめます。"cannot open shared object file: No such file or directory"というエラーが表示され...
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linux コマンド プロセス置換 無駄な一時ファイルを作らない

bashでは、複数のコマンドをパイプでつなぐことができます。しかし、入力をファイルからしか受け取らない一部のコマンドでは、わざわざ一時ファイルを準備する必要があって意外と面倒です。そんなときは、プロセス置換を活用しましょう。無駄な中間ファイ...
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bash パイプ 複数コマンド 組み合わせ

複数のコマンドを連続で処理すると、解析作業が効率的に進むときがあります。コマンドの出力結果をソートしたり、さらに絞り込みを行ったりするだけで、分り易い結果になることは良くあることかもしれません。そんなちょっとしたテクニックでは、パイプ(|)...
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linux コマンド tee 画面とファイルの両方へ出力

バイオインフォ道場、くまぞうです。コマンドを実行したとき、画面とファイルの両方に出力したいときがあります。しかし通常は、画面出力するとファイルには保存されないし、ファイルにリダイレクトすると画面には表示されません。画面は結果確認として、ファ...
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linux コマンド rm・rmdir ディレクトリ削除

バイオインフォ道場、くまぞうです。ディレクトリを削除するには、rmdirコマンドを使います。または、ファイル削除でも使うrmコマンドに-Rオプションをつけて削除します。rmdirは、空のディレクトリしか削除しないので、rmを良く使うかもしれ...
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linux コマンド cp ファイルコピー

バイオインフォ道場、くまぞうです。ファイルやディレクトリをコピーするには、cpコマンドを使います。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});コマンドの使い方基本的な使...
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ハードディスク容量が足りないかも! -df, duで使用量を確認-

バイオインフォマティクスでは比較的容量の大きいファイルを使用するので、ハードディスクの容量が足りなくなることもあります。慌てることが無いように、dfコマンドやduコマンドを使ってハードディスクの容量をこまめに確認しましょう。ディスクの使用状...
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linux コマンド md5sum ファイルのダウンロードチェック

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは、大きなデータを扱う機会が良くあります。大きなデータや大量のデータをネット経由でダウンロードする際は、きちんとダウンロードできたか心配になるときがあります。このようなとき、簡単に...
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