シェルスクリプト

シェルスクリプト case 条件分岐 スクリプトの書き方

シェルスクリプトのcase文は、ある条件に対していくつかの場合分けを行い、条件が一致したときに対応する処理を実行する処理です。変数には整数と文字列が使用できます。条件一致の判断は pattern を並べた順番に行われ、一致した最初の処理が実...
シェルスクリプト

シェルスクリプト while 条件と繰り返し スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。 while文は、ある条件が満たされる限り処理を繰り返す制御です。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push...
シェルスクリプト

シェルスクリプト testコマンド 条件評価 スクリプトの書き方

testコマンド は、色々な状態を評価することができます。文字列比較・ファイル属性確認・整数の比較についてまとめました。 文字列比較 文字列 str1 と str2 を比較します。 演算子条件str1 = str2st...
シェルスクリプト

シェルスクリプト for 単純な繰り返し スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。 for文は、一定回数もしくは条件で決められた集合要素に対して、繰り返し処理を行う制御構造です。リスト内の値が順番に1個ずつ変数に代入され、その1つ1つに対してdo〜doneまでの処理を実行します。尚...
シェルスクリプト

シェルスクリプト if 単純な条件分岐 スクリプトの書き方

バイオインフォ道場、くまぞうです。 シェルプログラミングのフロー制御で最も単純なのが「if文」です。条件に「一致したかどうか」という判断に基づいて、実行するコマンドを変更したりするときに使います。 スポンサーリンク ...
linuxに関すること

linux コマンド パイプの使い方

バイオインフォ道場、くまぞうです。 パイプはコマンドの処理を左から右へつなぐので、パイプライン処理と言います。「|」(パイプ:vertical line)の左側で実行したコマンドの結果を、「|」の右側のコマンドの入力として処理します。...
linuxに関すること

知ってると便利!コントロールキーのいろんな機能

バイオインフォ道場、くまぞうです。 コンソールでコマンドを使うときに覚えておいたほうが便利なキー操作をまとめます。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || [...
シェルスクリプト

シェルスクリプト Hello World スクリプトの書き方

シェルプログラミングをはじめましょう。使うシェルは「Bシェル」です。 Bシェルは機能が少ないのですが、どんなUNIXシステムでも動作するという利点があります。ログインシェルはbashやzshを使っている人が多いと思いますが、これらは...
R言語

R 知っていると便利!パッケージ読込みとヘルプ

Rのインストール済みのパッケージについて調べます。スクリプトがちゃんと動かないとき、「何がインストールされているか?」また、「何がインストールされていないか?」がヒントになるときがあります。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>...
メインコンテンツ

NCBI2R v1.4.7 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回は、NCBI2Rパッケージのインストールに挑戦です。 NCBI2Rパッケージは、NCBIから得られる情報を使ってSNPsや遺伝子にアノテーション情報を与えるパッケージです。 CRANから...
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