linuxに関すること

linux コマンド uniq ファイル内の重複行チェック

バイオインフォ道場、くまぞうです。 ソート済みのファイルから重複しない行を抽出します。ソートしていないファイルでは「uniq」処理できません。「sort」実行後に「uniq」処理するのを習慣化した方が良いと思います。 スポンサー...
R言語

R 使い方 組込みデータセット iris データフレーム・ベクトル・リスト

Rのデータ型について学びます。使うデータは、組込みデータセットの「iris」です。irisの構造を眺めたり要約統計量を求めることで、データフレーム・ベクトル型・リスト型について簡単に学びます。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>...
linuxに関すること

linux コマンド grep ファイル内の文字列検索

バイオインフォ道場、くまぞうです。 テキストファイル内の文字列を検索します。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); ...
linuxに関すること

linux コマンド sort ファイルのソート

バイオインフォ道場、くまぞうです。 テキストファイルの行をソートして並べ替えます。 構文 sort
linuxに関すること

Screen v4.01 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回は、Screenのインストールに挑戦です。 Screenは仮想端末マネージャです。コンソール内に複数のWindowを作ることができます。コンソールの分割や切り替えなどもできて大変便利なツー...
linuxに関すること

linux tar 圧縮ファイルの解凍 コマンド

Linuxでは tar コマンドで圧縮ファイルの作成・展開を行います。標準的に使われる圧縮形式gzip形式(.gz)とbzip2形式(.bz2)の展開を行うことができます。Linux の tar コマンドは、書庫化や圧縮・解凍も出来ますが、...
linuxに関すること

linux コマンド apt-get パッケージ管理

バイオインフォ道場、biくまぞうです。 Linuxのパッケージを管理します。インストールや、アンインストール、最新情報への更新などを行うときに使います。Debian系のディストリビューション(Ubuntu・SteamOSなど)で使用可...
R言語

R v3.2.3 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 今回はR v2.2.6のインストールに挑戦です。Rは、バージョンを指定してインストールしたい場合があるので、ソースコンパイル(make)でインストールしてみます。
R言語

R v3.0.2 – インストール

こんにちは、バイオインフォ道場 biくまぞうです。 今回はRのインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。 環境 Ubuntu Server 14.04 LTS(AWS) インストール パッケージ管理 # ...
Cufflinks

Cufflinks v2.2.1 – インストール

Cufflinks v2.2.1をインストールします。プリコンパイル版です。 インストール マニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。 場所 # cd /usr/local DL # wget \ cuffli...
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