バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]

FastQC – インストール

FastQCは、NGSのリードの品質をチェックするツールです。解析の直前で使用し、リードの品質に問題がなければ解析に進みます。もし、品質に問題があるようであれば、低品質の情報をトリミングツールで除去したり、対象となるデータを解析から外すな...

FastQCメインコンテンツ解析ツール

Java Runtimeのインストールについてです。 Javaで書かれた解析ツール（FastQCなど）を使用する場合は、インストールが必要です。尚、FastQC v0.11.4では1.6以上が必要。

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こんにちは、biくまぞうです。今回はRubyのインストールに挑戦です。スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); R...

Rubyメインコンテンツ

SAM tools のインストールについて、バージョン毎にまとめました。手順は同じ。指定バージョンを探すのが面倒なので、それぞれ整理しました。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談インストール...

samtoolsメインコンテンツ解析ツール

今回はbowtie2 v2.2.6のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談インストールマニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。 ...

bowtieメインコンテンツ解析ツール

今回は、Tophat2 v2.1.0 のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談準備 Tophat2が内部で利用する解析ツールを事前にインストールしま...

tophat2メインコンテンツ解析ツール

バイオインフォ道場、biくまぞうです。ファイルの単語数や行数を表示します。スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); ...

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バイオインフォ道場、くまぞうです。ファイルやディレクトリの削除を行います。スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); 構...

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バイオインフォ道場、くまぞうです。ファイルの別ディレクトリへの移動、または、ファイル名の変更を行います。スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).p...

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ディレクトリを作成します。構文 mkdir ... DIRECTORY... 主なオプション -p, --parents 指定したディレクトリをサブディレクトリも含めて作成 DIRECTORY 作成するディレクト...

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