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Excel

z-score 計算方法 エクセル(Excel) 編

統計処理で、大きく変化しているなどの判断基準にも使われる値として、Z-scoreがあります。Excel(エクセル)を使って求めてみます。関連記事z-score 計算方法 R 編R と Excel 分散 標準偏差 計算 データの散らばりについ...
Excel

Excel 関数 使い方 IFで「#DIV/0!」を回避

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは、表形式のデータをよく使います。表形式のデータ表示にはExcelがぴったりです。ちょっとしたデータ編集をすることもあります。こんなときに関数が使えると作業が捗ることがあります。わ...
シェルスクリプト

シェルスクリプト | ファイル存在チェック・空ファイルチェック

bashでスクリプトを作成するときに、よく使うのがファイルの存在チェックです。if文と組合せると、ファイルの有無によって処理を分けることができます。エラー処理も記述できて使いやすいスクリプトになります。様々な処理で活用できるので、是非参考に...
awk

IGV 使い方 遺伝子位置や好きな位置への移動

IGVはリードのマッピング状況を視覚的に確認できるツールです。ゲノムデータ(fastaファイル)とアライメントデータ(bamファイル、及びbaiファイル)を準備すれば簡単に表示できますが、更に遺伝子の位置情報を読み込むともっと使いやすくなり...
FastQC

FastQC 使い方 コマンドラインでテキスト形式の結果を活用する

バイオインフォマティクスの解析を行う際、一番最初に行うのはリードの品質チェックです。代表的なツールはFastQCで結果を視覚的に確認できて非常に便利ですが、たくさんデータを使う場合はコマンドライン(command line)を活用して結果を...
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バイオインフォマティクスの転職や就職に役立つ資格

バイオインフォマティクスなど理系の就職や転職バイオインフォマティクスなど理系の就職・転職を有利に進めるなら、技術や能力をアピールできる資格を計画的に増やしていくなどのメンテナンスが良い方法の1つです。もしあなたが企業の採用担当者だとしたら、...
linuxに関すること

linux コマンド プロセス置換 無駄な一時ファイルを作らない

bashでは、複数のコマンドをパイプでつなぐことができます。しかし、入力をファイルからしか受け取らない一部のコマンドでは、わざわざ一時ファイルを準備する必要があって意外と面倒です。そんなときは、プロセス置換を活用しましょう。無駄な中間ファイ...
R言語

R 使い方 データ構造まとめ スクリプトの書き方

Rで使うデータ構造をまとめてみます。一気に眺めることで、それぞれの特徴を理解できるかもしれません。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談Rのデータ構造ベクトルベクトルは、最も基本的な構造をしています。数値や文字などの1...
Excel

R 使い方 データ 読込み テキスト,csv,エクセル,データベース スクリプトの書き方

「統計ソフト R」にデータを読み込むのは簡単です。タブ区切りのデータやエクセル・DBなどからデータを取り込むことができます。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談Rにデータを読み込む「統計ソフト R」にデータを読み込む...
R言語

R 使い方 凡例・エラーバー・グラフ保存などの図の仕上げ グラフの描き方

「統計ソフト R」によるチャートやグラフの描画は、手軽で大変便利です。ただ、仕上げには細かい調整が必要です。今回は、そのようなときに役立つ「凡例」や「エラーバー」の描き方に関するテクニックをまとめます。とにかく早く問題解決したい人はこちら>...
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