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R 使い方 | volcano plot 描き方（ボルケーノプロット）

volcano plotは、発現解析の結果を表現でよく使われるグラフです。横軸に発現比(logFC)、縦軸にpvalue(-log10した値)をとります。Rを使って、volcano plot （ボルケーノプロット）を作成します。とにかく早...

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Rのインストール手順について。最近よくつかう「tidyverse」も一緒にインストールします。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談R 4.0 インストール手順事前設定$ sudo apt update -qq$ su...

R言語tidyverseメインコンテンツ

ベン図を入れ替える場合、左右の回転を指定します。１８０度で左右反転します。venn.diagram(x=list("A"=1:9, "B"=5:16), filename="venn_diagram.tiff", scaled=F, cat...

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bioinformatics では「R」をよくつかいますが、パッケージのインストールなのでトラブルことがあります。アノテーション作業で使う機会があるかもしれない、AnnotationHub インストールについて。RとBioconductor...

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Ansible で Ruby 環境を整えるAWS EC2 のインスタンスに、Ansible で Rubyの環境を整えます。rbenv をインストール、rbenv install で Ruby（指定バージョン）をインストールします。Playb...

AWSRubylinuxに関することメインコンテンツ

/var/lib/dpkg/lock error 回避方法AWS EC2 でUbuntu のインスタンスを生成した場合、apt update や apt install でエラーが発生することがあります。Ansible版、コンソール版、それ...

AWSlinuxに関することメインコンテンツ

Rustってどんなプログラミング言語？Rustって何が面白いんだろう？Rustって何でそんなに人気があるんだろう？Rustは、将来、仕事に役立つだろうか？そんな風に考えたことありませんか？私もそんな風に考える一人でした。見た目が、C・C++...

linuxに関することメインコンテンツ

pandocを使えば、テキストからWordファイル・PDFファイルへの変換が簡単にできるようになります。pandoc とは？pandocは、ドキュメント変換ツールです。コマンド操作で、テキストファイルからWordファイル・PDFファイルへ変...

linuxに関することメインコンテンツ

VisiDataを使えば、Linuxでスプレットシート形式のデータが扱いやすくなります。VisiData とは？VisiDataは、コンソール画面上でエクセルやtsvなどのスプレットシート形式のデータを、見やすく・便利に扱えるツールです。V...

Excellinuxに関することメインコンテンツ

Midnight CommanderはCUIベースのファイルマネージャーです。マウス操作なしで、ファイル操作を快適に行うことができます。表示が２カラムに分かれていて、コピーなどフォルダをまたぐ操作の場合に、コピー先のフォルダの内容も同時に見...

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