linuxに関すること

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linuxに関すること

linux コマンド uniq ファイル内の重複行チェック

バイオインフォ道場、くまぞうです。ソート済みのファイルから重複しない行を抽出します。ソートしていないファイルでは「uniq」処理できません。「sort」実行後に「uniq」処理するのを習慣化した方が良いと思います。スポンサーリンク(adsb...
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linux コマンド grep ファイル内の文字列検索

バイオインフォ道場、くまぞうです。テキストファイル内の文字列を検索します。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});構文grep 文字列パターン
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linux コマンド sort ファイルのソート

バイオインフォ道場、くまぞうです。テキストファイルの行をソートして並べ替えます。構文sort
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Screen v4.01 – インストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。今回は、Screenのインストールに挑戦です。Screenは仮想端末マネージャです。コンソール内に複数のWindowを作ることができます。コンソールの分割や切り替えなどもできて大変便利なツールです。特にバイ...
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linux tar 圧縮ファイルの解凍 コマンド

Linuxでは tar コマンドで圧縮ファイルの作成・展開を行います。標準的に使われる圧縮形式gzip形式(.gz)とbzip2形式(.bz2)の展開を行うことができます。Linux の tar コマンドは、書庫化や圧縮・解凍も出来ますが、...
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linux コマンド apt-get パッケージ管理

バイオインフォ道場、biくまぞうです。Linuxのパッケージを管理します。インストールや、アンインストール、最新情報への更新などを行うときに使います。Debian系のディストリビューション(Ubuntu・SteamOSなど)で使用可能です。...
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Java JRE(Java Runtime Environment) – インストール

Java Runtimeのインストールについてです。Javaで書かれた解析ツール(FastQCなど)を使用する場合は、インストールが必要です。尚、FastQC v0.11.4では1.6以上が必要。
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linux コマンド wc ファイルの単語数と行数を数える

バイオインフォ道場、biくまぞうです。ファイルの単語数や行数を表示します。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});構文wc ... ...
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linux コマンド rm ファイル削除

バイオインフォ道場、くまぞうです。ファイルやディレクトリの削除を行います。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});構文rm ... FILE...主なオプション -...
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linux コマンド mv ファイル移動・名前変更

バイオインフォ道場、くまぞうです。ファイルの別ディレクトリへの移動、または、ファイル名の変更を行います。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});構文mv ... S...
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