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bowtie メモリー関連のエラー Warning: Exhausted best-first chunk memory for read

bowtieを--bestモードで実行したところ、メモリーに関するワーニング(警告)が大量に表示されました。エラーではないので処理は進んでいくのですが、「マッピング結果に影響を与えないか?」という点がとても気になりました。そこで、--chu...
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bowtie2 使い方 アライメント情報(alignment summary)をファイルに保存する

bowtie2のアライメント情報(alignment summary)をファイル保存する方法について考えます。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談bowtie2 アライメント情報と標準エラー出力Linuxのコマンド結...
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bowtie 使い方 マッピングとオプション

bowtie は、代表的なマッピングソフトです。高速にマッピング処理を行うことが出来ます。ただし、ギャップは考慮しません。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談Bowtie - 使い方まずは、インデックスファイルを作る...
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bowtie v1.1.2 – インストール

今回はbowtie v1.1.2のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談インストール場所cd /usr/localダウンロードwget 展開unzip bowtie-1.1...
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bowtie2 v2.2.6 使い方 インストール

今回はbowtie2 v2.2.6のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談インストールマニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。cd /usr/localwg...
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