bowtie

bowtie

bowtie メモリー関連のエラー Warning: Exhausted best-first chunk memory for read

bowtieを--bestモードで実行したところ、メモリーに関するワーニング(警告)が大量に表示されました。エラーではないので処理は進んでいくのですが、「マッピング結果に影響を与えないか?」という点がとても気になりました。そこで、--ch...
bowtie

bowtie2 使い方 アライメント情報(alignment summary)をファイルに保存する

bowtie2のアライメント情報(alignment summary)をファイル保存する方法について考えます。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 bowtie2 アライメント情報と標準エラー出力 ...
bowtie

bowtie 使い方 マッピングとオプション

bowtie は、代表的なマッピングソフトです。高速にマッピング処理を行うことが出来ます。ただし、ギャップは考慮しません。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 Bowtie - 使い方 まずは、...
bowtie

bowtie v1.1.2 – インストール

今回はbowtie v1.1.2のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 インストール 場所 cd /usr/local ダウンロード wget 展...
bowtie

bowtie2 v2.2.6 使い方 インストール

今回はbowtie2 v2.2.6のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 インストール マニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。 ...
タイトルとURLをコピーしました