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その他 学会・会議で英語が絶望的にできなくて困るケース | オンライン開催で「英語力のなさ」を痛感した場合の対処法
学会・会議で英語ができなくてに困るケース学会やイベント・会議などが、オンラインで開催されることが多くなりました。便利ですが、国際学会で、『英語力の無さに絶望』している人も多いみたいようです。苦手なら、ただでさえ緊張する英会話なのに、「電話や...
その他 
R言語 r tidyverse 使い方 | 列 filter 絞り込み select関数 – dplyrパッケージ
tidyverseで１つのデータフレームの列の絞り込みは、dplyrパッケージのselect関数を使います。selectは条件を満たす列を絞り込む関数です。様々な指定方法で絞り込みができます。列名と文字列条件のマッチや正規表現を利用した絞り...
その他 プログラミングで疲れた脳をリフレッシュ 〜 鬼滅の刃「感動」と「やる気アップ」でストレス発散！
ストレス発散は鬼滅で。「５０％OFF」で読む！脳のパフォーマンスを上げるには、適度な休憩とストレス発散も大事なんだそうです。最近、子供の影響で「鬼滅の刃」にはまっています。「感動」と「やる気アップ」がすごいです！通勤の帰りの電車の中が、たち...
AWS AWS ディスク容量不足 新しいボリュームを追加する
バイオインフォマティクスでは大きなファイルを扱うことがあるので、ディスク不足に陥ることがあります。最近、よく使われる AWS EC2 でディスクが不足した場合は、新しくボリュームを作成して、インスタンスにアタッチすることができます。ディスク...
R言語 tidyverse csv・tsvのファイルの読み方・データ型の指定方法 readrパッケージ
tidyverseを使う場合、ファイルの読み書きにはreadrパッケージの専用関数（read_tsv関数・read_csv関数）を使うのが便利です。これらの専用関数ではデータ・フレーム構造より使いやすいtibble型でデータを読み込みますが...
R言語 tidyverse インストールとロード tidyverseの主なパッケージ
tidyverseはRのパッケージの１つで、データ操作（抽出・連結など）を統合的に扱うためのツール群です。Rを起動後に、tidyverseのインストールを行います。インストール完了後は、使うときにパッケージをロードして使います。 とにかく早...
その他 「知っている」と「知らない」とでは、もしものとき、大違いになる – コロナうつ対策
コロナうつなどという言葉を聞くようになりましたが、派遣切り、解雇、リストラは、これから本格化します。特に、ITが関係する仕事は、「うつ」が多い職種です。実際、私の上司も、私の後輩も突然うつになって、会社に来ることができなくなりました。しかも...
linuxに関すること 解析トラブル Linuxマシンの動作のもたつき 原因調査と解決策
バイオインフォマティクス解析で使用するツールは、計算が長く続いたり、メモリを大量に必要とするもの、たくさんのファイルを出力するものなど、大きな負荷がかかるものが多いです。このようなツールを使う場合、コンピュータのパフォーマンス管理がしっかり...
AWS はじめてのcrontab実行 AWS S3へ自動バックアップ
バイオインフォマティクスでは、重要なデータを使うことが多いのでバックアップ作業などは定期的に実行したいものです。確実に、そして簡単に、データバックアップのような単純な処理を、定期的に実行してくれるcrontabを試してみましょう！cront...
linuxに関すること 不要なファイルを探す ファイル名・ファイルサイズ・ファイル更新日時
バイオインフォマティクスの解析では大きなファイルを扱うことが多いので、ストレージの管理には気を使います。ストレージの容量を確保するために、不要なファイルはこまめに削除（または他の場所へ移動・圧縮など）することが、もっとも簡単で確実な方法だと...