バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]

R 使い方データフレーム・ファクタースクリプトの書き方

Rのデータフレーム・ファクターは、他のプログラミング言語のデータ構造とは異なる独特な構造。でも、とてもよく使う構造で、必ず使いこなせるようになりましょう。基本的な構造を理解すれば、Ｒはもっと使いやすいツールになります。Rのデータフレームとフ...

R言語メインコンテンツ

統計処理で、大きく変化しているなどの判断基準にも使われる値として、Z-scoreがあります。Excel（エクセル）を使って求めてみます。関連記事z-score 計算方法 R 編R と Excel 分散標準偏差計算データの散らばりについ...

Excelメインコンテンツ統計

バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスでは、表形式のデータをよく使います。表形式のデータ表示にはExcelがぴったりです。ちょっとしたデータ編集をすることもあります。こんなときに関数が使えると作業が捗ることがあります。わ...

Excelメインコンテンツ

bashでスクリプトを作成するときに、よく使うのがファイルの存在チェックです。if文と組合せると、ファイルの有無によって処理を分けることができます。エラー処理も記述できて使いやすいスクリプトになります。様々な処理で活用できるので、是非参考に...

シェルスクリプトメインコンテンツ

IGVはリードのマッピング状況を視覚的に確認できるツールです。ゲノムデータ（fastaファイル）とアライメントデータ（bamファイル、及びbaiファイル）を準備すれば簡単に表示できますが、更に遺伝子の位置情報を読み込むともっと使いやすくなり...

IGVawkメインコンテンツ解析ツール

バイオインフォマティクスの解析を行う際、一番最初に行うのはリードの品質チェックです。代表的なツールはFastQCで結果を視覚的に確認できて非常に便利ですが、たくさんデータを使う場合はコマンドライン（command line）を活用して結果を...

FastQCメインコンテンツ解析ツール

バイオインフォマティクスなど理系の就職や転職バイオインフォマティクスなど理系の就職・転職を有利に進めるなら、技術や能力をアピールできる資格を計画的に増やしていくなどのメンテナンスが良い方法の１つです。もしあなたが企業の採用担当者だとしたら、...

メインコンテンツ統計資格・就職

bashでは、複数のコマンドをパイプでつなぐことができます。しかし、入力をファイルからしか受け取らない一部のコマンドでは、わざわざ一時ファイルを準備する必要があって意外と面倒です。そんなときは、プロセス置換を活用しましょう。無駄な中間ファイ...

linuxに関することメインコンテンツ

Rで使うデータ構造をまとめてみます。一気に眺めることで、それぞれの特徴を理解できるかもしれません。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談Ｒのデータ構造ベクトルベクトルは、最も基本的な構造をしています。数値や文字などの１...

R言語メインコンテンツ統計

「統計ソフト R」にデータを読み込むのは簡単です。タブ区切りのデータやエクセル・DBなどからデータを取り込むことができます。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談Rにデータを読み込む「統計ソフト R」にデータを読み込む...

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