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htop – Linux 動作のもたつき原因調査に使えるツール

htop とはhtopは、CLIで動作するタスクマネージャーである。topの置き換えを目標に設計された。デフォルトでは、プロセスはCPU使用率の順に並べられる。topでは最もリソースを消費するプロセスのリストが提供されるが、htopでは全て...

linuxに関することメインコンテンツ

Miniconda install公式サイトから、最新版 Miniconda installer（各OS毎）のシェルファイルをダウンロードします。Miniconda$ wget $ bash Miniconda3-latest-Linux-...

bioconda

trinotateは、trinityのアセンブル結果にアノテーションをつけるツールです。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談trinotate installTrinotate便利なツールなのですが、インストールが必...

Trinitybiocondatrinotateメインコンテンツ

多くの人が休み明けの月曜日は、行きたく無いなどと思うものですが、実際に会社や学校を休むことはなく、仕方がないと家を出発することでしょう。しかし、もっとも自殺が多いのは、長期休暇の終わりです。お正月休みになると、後輩として慕っていた男性から、...

その他

USBメモリのフォーマットがFATだと、ファイルサイズの上限は４G程。コピーでエラーになることがあります。USBメモリのフォーマット | Ubuntu nautilusUbuntuでは、nautilus（windowsでいうエクスプローラ）...

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Trinityを、一番「簡単に動かす方法」だと思います。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談Trinity in Docker 使い方アセンブルツール Trinity（de novo transcriptome as...

Trinityメインコンテンツ

Fastqファイル用の高速前処理ツールです。クオリティの評価（トリミング前後）やトリミング処理を行います。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談fastp とは？fastp : fastp 使い方簡単な使い方シングルエ...

FastQCfastpメインコンテンツ解析ツール

awkは、テキスト処理に欠かせません。よく使う「行を指定した処理」に使える定型スクリプトをまとめました。簡単に書けるように、省略できる部分は極力省きました。awk と行awkで行を指定して「何かの処理」を実行するときは、「いま何行目？」を...

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何かコマンドからの出力を簡単にファイルに残しておけるので、リダイレクトは良く使います。しかし、たまに大事な既存ファイルに上書きしてしまって失敗することがあります。そんな「よくあるリダイレクトミス」を防ぎましょう！リダイレクトで上書き禁止する...

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Pythonは、最も学習しやすいプログラミング言語の１つです。ライブラリが豊富で、機械学習の分野でも使われることが多い、人気のプログラミング言語です。そんなPythonの便利なディストリビューション、「Anaconda」をインストールして、...

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