![バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]](https://bioinfo-dojo.net/wp-content/uploads/2016/03/some_object_luca-bravo-alS7ewQ41M8-unsplash.jpg)
AWS AWS Amazon EC2 使い方 インスタンスへコマンド送信（EC2 コンソール編）
バイオインフォ道場、くまぞうです。Amazon EC2 System Manager（SSM）を使って、生成済みのAWS EC2のインスタンス（Linux - Ubuntu）にわざわざログインせずにコマンド実行します。EC2コンソールを使い...
bioinfo-dojo
AWS Python Python リスト 使い方 スクリプトの書き方
バイオインフォ道場、くまぞうです。Pythonで複数のデータを順番に管理するには、リストを使うと便利です。リストを使うための簡単な操作を確認します。インタラクティブシェル（>>>）を使うと確認しやすいです。スポンサーリンク(adsbygoo...
Python Python ファイル処理 読み込み・書き込み スクリプトの書き方
バイオインフォ道場、くまぞうです。Pythonでファイル処理を行う場合の、読み込み・書き込みについて簡単な操作を確認します。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});...
Python Python 文字列処理 連結・分割・検索・置換 スクリプトの書き方
バイオインフォ道場、くまぞうです。Pythonでスクリプトを書く場合の、文字列処理について簡単な演算を確認します。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});Pytho...
Excel Excel 関数 使い方 複数条件でフィルタリングのヒント
バイオインフォ道場、くまぞうです。Excelは解析結果でよく使うソフトウェアです。条件付書式を指定して色分けしたり、フィルタリングやカラーフィルターなど便利な機能を使うことができます。ただ、これらを複数の条件で適用したい場合は少し面倒に感じ...
AWS Amazon AWS 使い方 スポットインスタンスで高性能なサーバーを格安利用する
バイオインフォ道場、くまぞうです。データ解析用のサーバーとしてAmazon EC2を利用している方も多いと思います。スポットリクエストは未使用のEC2インスタンスを入札方式で利用できる方法で、通常のオンデマンド利用よりも大変安く利用すること...
Python Python 変数と演算 スクリプトの書き方
バイオインフォ道場、くまぞうです。Pythonでスクリプトを書く場合の、変数の使い方・簡単な演算を確認します。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});変数変数の使い...
R言語 R 使い方 while 繰り返し スクリプトの書き方
Rで「条件を満たす間ずっと繰り返し」を行う場合は、whileを使います。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談while スクリプトの書き方while文は、条件式と一緒に書きます。条件を満たす間、一連の文やブロックをず...
FASTX-Toolkit FASTX-Toolkit 使い方 インストール
FASTX-Toolkitは、次世代シーケンサのFASTA・FASTQの前処理に関連するツールを集めたものです。トリミングやクリッピング、クオリティ処理に関するツールが提供されています。インストール方法について手順を整理します。とにかく早く...
htseq-count htseq-count 使い方 gene単位・transcript単位の数え方
RNA-Seq解析では、ゲノムに張りついたリードの数を数えます。gene単位・transcript単位の数え方は、オプションで切り替えることができます。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談htseq-count 使い...