![バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]](https://bioinfo-dojo.net/wp-content/uploads/2016/03/some_object_luca-bravo-alS7ewQ41M8-unsplash.jpg)
awk awk 行の表示 先頭行 最終行 指定行
awkは、テキスト処理に欠かせません。よく使う「行を指定した処理」に使える定型スクリプトをまとめました。簡単に書けるように、省略できる部分は極力省きました。awk と 行awkで行を指定して「何かの処理」を実行するときは、「いま何行目？」を...
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awk linuxに関すること bash リダイレクションによる上書き禁止
何かコマンドからの出力を簡単にファイルに残しておけるので、リダイレクトは良く使います。しかし、たまに大事な既存ファイルに上書きしてしまって失敗することがあります。そんな「よくあるリダイレクトミス」を防ぎましょう！リダイレクトで上書き禁止する...
Python Python Anaconda インストール & Jupyter Notebook 起動 Linux(ubuntu)編
Pythonは、最も学習しやすいプログラミング言語の１つです。ライブラリが豊富で、機械学習の分野でも使われることが多い、人気のプログラミング言語です。そんなPythonの便利なディストリビューション、「Anaconda」をインストールして、...
シェルスクリプト ファイル名を一括変更 Windowsエクスプローラーとシェルスクリプト
バイオインフォマティクスでは、データファイルが大量になることがあります。いつも頭を悩ませるのがデータの管理です。たまにファイル名を一括で変更したいときがありますが、便利な方法があるので紹介したいと思います。Windows エクスプローラーで...
Excel Excelショートカットを覚えて 作業効率アップ
バイオインフォ道場、くまぞうです。バイオインフォマティクスのデータはExcelと相性の良いものが多いです。Excelの操作にショートカットを使うとマウスの操作より速くて便利です。Excelのショートカットはたくさんあるので色々調べてみましょ...
linuxに関すること パスワード自動生成 APG Linuxコマンドの使い方
バイオインフォ道場、くまぞうです。パスワードは「１つのサービスに１つのパスワード」で使い回しを避けるスポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});大きなデータを日常的に扱...
MACS2 macs2 install & 使い方
MACS2、良く使われている ChIP-Seq 解析用の peak caller です。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談macs2色々なサイトで、macs2 のインストール方法や使い方がまとめられていますが、バー...
HISAT2 hisat2 使い方 | index 作成
HISAT2のindexファイルを、hisat2-buildコマンドで自ら生成します。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談HISAT2は、高速かつ正確に次世代シーケンシング（NGS）データをリファレンスゲノムにマッピ...
シェルスクリプト bash 配列の使い方｜サンプルでわかる最低限の知識
bash 配列の使い方について、初期化・参照・削除のやり方〜配列を使った繰り返し処理まで、最低限の知識を短いサンプルで理解できます！bash の配列を理解すると、シェルスクリプトの応用の幅が広がります。bash 配列の使い方bash 配列の...
シェルスクリプト シェルスクリプト 変数 使い方
シェルスクリプト 変数シェルスクリプト 変数 名前のつけ方と定義シェルで変数を使うとき、最初に注意することです。名前には、アルファベット（大／小文字を区別）・数字・アンダースコアを使える。名前には、１文字目に数字は使えない。名前には、アルフ...