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Excel

LibreOffice より使いやすいかも! 動作が軽くて Microsoft Office と互換性も高い FreeOffice

Ubuntuを使用する場合、デフォルトのオフィススイートであるLibreOfficeをよく使っていますが、「動作が軽くて、Microsoft Office文書と互換性が高い」と言われている、FreeOfficeを使ってみました。Office...
シェルスクリプト

bash 算術計算 書き方

シェルスクリプトを書いているとき、計算式が使えると便利なことがあります。ファイルの残りの行数を表示したいな行毎に項目を足して合計を表示したいな入力したデータを計算して処理に使いたいないろいろな状況があると思いますが、bashでも算術計算は可...
linuxに関すること

データの使用量を確認する ディスク使用量アナライザーで視覚的に確認できる

バイオインフォマティクスでは大きなデータを使用するので、ひと目で大きなデータがわかると重宝します。そのようなファイルは、シェルで検索することもできますが、ディスク使用量アナライザーを使えばGUIで視覚的に確認することができます。ディスク使用...
linuxに関すること

破壊するか上書きするか、安全なデータ破棄について

「データは削除したから大丈夫!」と思っていても、廃棄したPCやハードディスクから「消したはずの重要なデータ」が読み取られることがあります。データ削除とデータ復旧ソフト「データが外部に漏れてしまった!」ということがないように、PCの破棄・ハー...
シェルスクリプト

ImageMagick 使い方 一括画像処理のスクリプト

画像処理を簡単に行う方法です。Linuxで作業を行う場合、ImageMagickを使うことが多いです。ImageMagickには、コマンドラインツールが豊富なので、バッチ処理などを使ってGUIを使わずとも画像処理ができるのが魅力です。面倒な...
linuxに関すること

htop – Linux 動作のもたつき 原因調査に使えるツール

htop とはhtopは、CLIで動作するタスクマネージャーである。topの置き換えを目標に設計された。デフォルトでは、プロセスはCPU使用率の順に並べられる。topでは最もリソースを消費するプロセスのリストが提供されるが、htopでは全て...
bioconda

Trinotate インストール | conda/biocondaを使って簡単インストール

trinotateは、trinityのアセンブル結果にアノテーションをつけるツールです。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談trinotate installTrinotate便利なツールなのですが、インストールが必...
linuxに関すること

大きなファイル USBメモリへのコピーでエラーが出たら UbuntuのエクスプローラーでNTFSフォーマット

USBメモリのフォーマットがFATだと、ファイルサイズの上限は4G程。コピーでエラーになることがあります。USBメモリのフォーマット | Ubuntu nautilusUbuntuでは、nautilus(windowsでいうエクスプローラ)...
Trinity

Trinity Docker 面倒な「install作業なし」で一発起動!

Trinityを、一番「簡単に動かす方法」だと思います。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談Trinity in Docker 使い方アセンブルツール Trinity(de novo transcriptome as...
fastp

fastp インストール・簡単な使い方・よく使うオプション

Fastqファイル用の高速前処理ツールです。クオリティの評価(トリミング前後)やトリミング処理を行います。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談fastp とは?fastp : fastp 使い方簡単な使い方シングルエ...
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