FASTX-Toolkit

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FASTX-Toolkit 使い方 インストール

FASTX-Toolkitは、次世代シーケンサのFASTA・FASTQの前処理に関連するツールを集めたものです。 トリミングやクリッピング、クオリティ処理に関するツールが提供されています。 インストール方法について手順を整理し...
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シェルスクリプト FASTAファイルの分割 fastx_toolkit, sed, コマンドの活用例

バイオインフォマティクスでは、大きなファイルを扱う機会が多いです。小さなファイルに分割すれば、サーバーで分散処理して大幅な時間短縮を行うことが出来るかもしれません。いくつかのツールを組合せてFASTAファイルを小さく分割してみます。 ...
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FASTX_Toolkitのインストール

バイオインフォ道場、くまぞうです。 FASTX_Toolkitインストールに挑戦です。 スポンサーリンク (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({}); ...
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塩基配列の表示幅を調整する – Fastaファイルの整形 –

Fastaファイルの整形についてまとめます。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 フォーマットを整える FASTX_Toolkitは、Fastq・Fasta形式のファイルについて前処理をしたり、...
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fastx_toolkit 使い方 FastqからFastaへ変換

Fastq・Fastaファイルともに、バイオインフォマティクスで良く使うファイル形式です。 FastqからFastaへ変換についてまとめます。 とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談 Fas...
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