![バイオインフォ 道場 [bioinfo-Dojo]](https://bioinfo-dojo.net/wp-content/uploads/2016/03/some_object_luca-bravo-alS7ewQ41M8-unsplash.jpg)
シェルスクリプト ImageMagick 使い方 一括画像処理のスクリプト
画像処理を簡単に行う方法です。Linuxで作業を行う場合、ImageMagickを使うことが多いです。ImageMagickには、コマンドラインツールが豊富なので、バッチ処理などを使ってGUIを使わずとも画像処理ができるのが魅力です。面倒な...
シェルスクリプト 
その他 他人事ではない、「うつ」
介護と仕事の疲れで、精神的に苦しんでいる仕事仲間がいました。私も、実家の母が糖尿病を悪くして週３日は透析を行っているので、気持ちが良くわかって、普段から様子を気にかけていました。彼女は、仕事も一生懸命、介護も一生懸命と責任感が強く、頑張り屋...
linuxに関すること htop – Linux 動作のもたつき 原因調査に使えるツール
htop とはhtopは、CLIで動作するタスクマネージャーである。topの置き換えを目標に設計された。デフォルトでは、プロセスはCPU使用率の順に並べられる。topでは最もリソースを消費するプロセスのリストが提供されるが、htopでは全て...
bioconda Miniconda 使い方 | インストール と 環境作成・環境利用
Miniconda install公式サイトから、最新版 Miniconda installer（各OS毎）のシェルファイルをダウンロードします。Miniconda$ wget $ bash Miniconda3-latest-Linux-...
bioconda Trinotate インストール | conda/biocondaを使って簡単インストール
trinotateは、trinityのアセンブル結果にアノテーションをつけるツールです。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談trinotate installTrinotate便利なツールなのですが、インストールが必...
その他 うつになると、簡単に相談できない・・・
多くの人が休み明けの月曜日は、行きたく無いなどと思うものですが、実際に会社や学校を休むことはなく、仕方がないと家を出発することでしょう。しかし、もっとも自殺が多いのは、長期休暇の終わりです。お正月休みになると、後輩として慕っていた男性から、...
linuxに関すること 大きなファイル USBメモリへのコピーでエラーが出たら UbuntuのエクスプローラーでNTFSフォーマット
USBメモリのフォーマットがFATだと、ファイルサイズの上限は４G程。コピーでエラーになることがあります。USBメモリのフォーマット | Ubuntu nautilusUbuntuでは、nautilus（windowsでいうエクスプローラ）...
Trinity Trinity Docker 面倒な「install作業なし」で一発起動！
Trinityを、一番「簡単に動かす方法」だと思います。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談Trinity in Docker 使い方アセンブルツール Trinity（de novo transcriptome as...
fastp fastp インストール・簡単な使い方・よく使うオプション
Fastqファイル用の高速前処理ツールです。クオリティの評価（トリミング前後）やトリミング処理を行います。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談fastp とは？fastp : fastp 使い方簡単な使い方シングルエ...
awk awk 行の表示 先頭行 最終行 指定行
awkは、テキスト処理に欠かせません。よく使う「行を指定した処理」に使える定型スクリプトをまとめました。簡単に書けるように、省略できる部分は極力省きました。awk と 行awkで行を指定して「何かの処理」を実行するときは、「いま何行目？」を...