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linux tar 圧縮ファイルの解凍コマンド

Linuxでは tar コマンドで圧縮ファイルの作成・展開を行います。標準的に使われる圧縮形式gzip形式（.gz）とbzip2形式（.bz2）の展開を行うことができます。Linux の tar コマンドは、書庫化や圧縮・解凍も出来ますが、...

linuxに関することメインコンテンツ

バイオインフォ道場、biくまぞうです。Linuxのパッケージを管理します。インストールや、アンインストール、最新情報への更新などを行うときに使います。Debian系のディストリビューション（Ubuntu・SteamOSなど）で使用可能です。...

linuxに関することメインコンテンツ

バイオインフォ道場、くまぞうです。今回はR v2.2.6のインストールに挑戦です。Rは、バージョンを指定してインストールしたい場合があるので、ソースコンパイル（make）でインストールしてみます。

R言語メインコンテンツ

こんにちは、バイオインフォ道場 biくまぞうです。今回はRのインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。環境Ubuntu Server 14.04 LTS（AWS）インストールパッケージ管理# sudo apt-get install r...

R言語メインコンテンツ

Cufflinks v2.2.1をインストールします。プリコンパイル版です。インストールマニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。場所# cd /usr/localDL# wget \cufflinks-2.2.1.Linux...

Cufflinksメインコンテンツ解析ツール

FastQCは、NGSのリードの品質をチェックするツールです。解析の直前で使用し、リードの品質に問題がなければ解析に進みます。もし、品質に問題があるようであれば、低品質の情報をトリミングツールで除去したり、対象となるデータを解析から外すなど...

FastQCメインコンテンツ解析ツール

Java Runtimeのインストールについてです。Javaで書かれた解析ツール（FastQCなど）を使用する場合は、インストールが必要です。尚、FastQC v0.11.4では1.6以上が必要。

linuxに関することメインコンテンツ

こんにちは、biくまぞうです。今回はRubyのインストールに挑戦です。スポンサーリンク(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});Rubyプログラム言語としてRubyを使用する場合は、...

Rubyメインコンテンツ

SAM tools のインストールについて、バージョン毎にまとめました。手順は同じ。指定バージョンを探すのが面倒なので、それぞれ整理しました。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談インストールインストール情報に従い、ダ...

samtoolsメインコンテンツ解析ツール

今回はbowtie2 v2.2.6のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。とにかく早く問題解決したい人はこちら＞＞直接、データ解析相談インストールマニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。cd /usr/localwg...

bowtieメインコンテンツ解析ツール