バックグラウンド実行とフォアグラウンド実行 -プログラムの色んな実行方法-

スポンサーリンク

解析プログラムは長い時間を必要とするものもあります。プログラムの実行や管理方法を理解して、作業効率を効率的に行いましょう。

バックグラウンド実行とフォアグラウンド実行

バックグラウンド実行をうまく活用しよう

プログラムの実行には、起動後その場で終了を待ち続けるフォアグラウンド実行と、起動が済んだら終了を待たないバックグラウンド実行があります。解析プログラムを使って計算終了を待つことが多ければ、バックグラウンド実行できないか?を検討すると良いかもしれません。適切に起動を行ったら、すぐに他の作業にとりかかることが出来ます。

プログラムをバックグラウンド実行で動かす

プログラム(例えば、コマンドやスクリプト)をバックグラウンドで動かすのは、簡単です。通常のコマンド実行の後ろに「&」をつけるだけです。

  $ ruby test_jobs.rb             # 通常実行(フォアグラウンド実行)
                                  # 全ての処理が終わるまで待ち続ける
  $ ruby test_jobs.rb &           # & を指定して、バックグラウンド実行
  $                               # 処理中でもプロンプトが出て他の作業を実行できる。
  $ ruby test_jobs.rb "HELLO!" &  # & を指定して、バックグラウンド実行
  $                               # 処理中でもプロンプトが出て他の作業を実行できる。

プロセスの状態を確認する

フォアグラウンド実行やバックグラウンド実行で動かしたプログラムの状態は、psコマンドで確認できます。下記は、「test_jobs.rb」をバックグラウンドで実行した状態です。プロセスID 7383で実行され、その後完了しています。

  $ ps
  PID TTY          TIME CMD
  5360 pts/3    00:00:00 bash
  7383 pts/3    00:00:00 ruby
  7386 pts/3    00:00:00 ps

  $ ps
  PID TTY          TIME CMD
  5360 pts/3    00:00:00 bash
  7429 pts/3    00:00:00 ps
  [2]+  終了    ruby test_jobs.rb

時間がかかるプログラムをバックグラウンド実行で動かす

test_jobs.rb

ファイル(test_jobs.txt)に、10秒おきにメッセージを書き込むプログラムです。メッセージは引数で与えます(デフォルトは”hello!”)。全てのメッセージを書き終わったら終了です。

フォアグラウンド実行では時間がかかるので、バックグラウンド実行がオススメです。バックグラウンド実行したら、psコマンドでプログラムの状態を確認しましょう。しばらく経ってバックグラウンド実行が完了すると、端末画面で何かの操作をおこなったときに、完了メッセージが表示されます。全てのメッセージが書き込まれたかをcatなどのコマンドで確認しましょう。

  $ ruby test_jobs.rb             # 通常実行(フォアグラウンド実行)
                                  # 全ての処理が終わるまで待ち続ける
  $ ruby test_jobs.rb &           # & を指定して、バックグラウンド実行
  $                               # 処理中でもプロンプトが出て他の作業を実行できる。
#! /usr/bin/ruby

File.open("test_jobs.txt", "w") do |f|
  10.times do
    f.puts ARGV[0] ? ARGV[0] : "hello!"
    sleep(10)
  end
end

関連記事1

bash 算術計算 書き方
シェルスクリプトを書いているとき、計算式が使えると便利なことがあります。ファイルの残りの行数を表示したいな行毎に項目を足して合計を表示したいな入力したデータを計算して処理に使いたいないろいろな状況があると思いますが、bashでも算術計算は可...
bash リダイレクションによる上書き禁止
何かコマンドからの出力を簡単にファイルに残しておけるので、リダイレクトは良く使います。しかし、たまに大事な既存ファイルに上書きしてしまって失敗することがあります。そんな「よくあるリダイレクトミス」を防ぎましょう!リダイレクトで上書き禁止する...
bash 配列の使い方|サンプルでわかる最低限の知識
bash 配列の使い方について、初期化・参照・削除のやり方〜配列を使った繰り返し処理まで、最低限の知識を短いサンプルで理解できます!bash の配列を理解すると、シェルスクリプトの応用の幅が広がります。bash 配列の使い方bash 配列の...
シェルスクリプト bash 最新版の利用
シェルスクリプト bash 最新バージョンシェルスクリプト bash バージョン確認bashのバージョン確認を行います。現在、最新版はバージョン4.4(2017年1月)です。$ bash --versionbash --versionGNU...
bash 部分文字列・置換・長さ・連結・分割の文字列処理
bashのよく使う文字列処理、部分文字列・置換・連結・長さ・分割について、サンプルを交えながらまとめます。とにかく早く問題解決したい人はこちら>>直接、データ解析相談部分文字列文字列から部分文字列を取り出すときは、位置を指定した抽出方法か、...
bash パイプ 複数コマンド 組み合わせ
複数のコマンドを連続で処理すると、解析作業が効率的に進むときがあります。コマンドの出力結果をソートしたり、さらに絞り込みを行ったりするだけで、分り易い結果になることは良くあることかもしれません。そんなちょっとしたテクニックでは、パイプ(|)...
linux コマンド プロセス置換 無駄な一時ファイルを作らない
bashでは、複数のコマンドをパイプでつなぐことができます。しかし、入力をファイルからしか受け取らない一部のコマンドでは、わざわざ一時ファイルを準備する必要があって意外と面倒です。そんなときは、プロセス置換を活用しましょう。無駄な中間ファイ...

関連記事2

xargs 引数を上手に使う | find と xargs でファイルのリネームやコピーをひと工夫
bioinformaticsでは、たくさんのファイルを使うことが多いので、ファイル処理は効率的に行いたいですね。このようなときfind コマンドや xargs コマンドが役に立ちます。例えば、fastqファイルの拡張子を、fq.gz から ...
パス名からファイル名を取得する方法
パス名からファイル名を抽出する場合は、basenameコマンドを使うと簡単です。$ find . -name "test.txt" /aaa/bbb/ccc/test.txt $ find . -name "test.txt" | xarg...
不要なファイルを探す ファイル名・ファイルサイズ・ファイル更新日時
バイオインフォマティクスの解析では大きなファイルを扱うことが多いので、ストレージの管理には気を使います。ストレージの容量を確保するために、不要なファイルはこまめに削除(または他の場所へ移動・圧縮など)することが、もっとも簡単で確実な方法だと...
ファイル名を一括変更 Windowsエクスプローラーとシェルスクリプト
バイオインフォマティクスでは、データファイルが大量になることがあります。いつも頭を悩ませるのがデータの管理です。たまにファイル名を一括で変更したいときがありますが、便利な方法があるので紹介したいと思います。Windows エクスプローラーで...
シェルスクリプト 引数の与え方とチェック方法
シェルスクリプトに引数を与える場合、引数が少ない場合はエラーにするなどの対策が必要です。一方、引数を10個以上うけとる場合、受け取り側で引数をずらしながら1つずつ取得する必要があります。シェルスクリプトの引数をチェックする方法シェルスクリプ...
シェルスクリプト 引数の与え方とチェック方法
シェルスクリプトに引数を与える場合、引数が少ない場合はエラーにするなどの対策が必要です。一方、引数を10個以上うけとる場合、受け取り側で引数をずらしながら1つずつ取得する必要があります。シェルスクリプトの引数をチェックする方法シェルスクリプ...
シェルスクリプト 関数 スクリプトの書き方
今回は、プログラムの基本構成となる「関数」を作ってみます。シェルで関数を作成すると、普段シェルを使って行っている作業を色々と自動化できて便利なことがあります。少しずつ、使えるようになると良いですね。関数を利用したプログラムメッセージを1つず...
シェルスクリプト select メニューを作る スクリプトの書き方
select文を使うと、簡単にメニューを作成することができます。但し、Bシェルでは使えず bash を使います。リストでメニュー項目を準備します。select内の変数で、選ばれた項目や入力値を取得することができます。メニュープロンプトは、P...
シェルスクリプト Hello World スクリプトの書き方
シェルプログラミングをはじめましょう。使うシェルは「Bシェル」です。Bシェルは機能が少ないのですが、どんなUNIXシステムでも動作するという利点があります。ログインシェルはbashやzshを使っている人が多いと思いますが、これらはBシェルの...
タイトルとURLをコピーしました