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blast 使い方 インストール blast+ v2.3.0

バイオインフォ道場、くまぞうです。

今回はblast+のインストールに挑戦です。プリコンパイル版です。

インストール

マニュアルに従い、プリコンパイル版をインストールします。

• 場所

  # cd /usr/local

• ダウンロード

  # wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.3.0/ncbi-blast-2.3.0+-x64-linux.tar.gz

• 展開

  # tar xzvf ncbi-blast-2.3.0+-x64-linux.tar.gz

• リンク

  # cd ncbi-blast-2.3.0+/bin
  # ln -s /usr/local/ncbi-blast-2.3.0+/bin/* /usr/local/bin

インストール確認

blast+のコマンド（例：blastn） を呼び出して、バージョンが表示されればインストール完了です。

$ blastn -version

参考情報

BLAST Help [internet]. (NCBI)